Aritalab:Lecture/NetworkBiology/Software

ソフトウェア

Pajek

利用法

1. Pajekのサイトから最新版をダウンロードしてインストールする
2. 同じくPajekのデータサイトから、酵母のタンパク質相互作用データをダウンロードして解凍する (.net ファイル)
3. Pajek を起動し、File → Network → Read から、解凍して出てきた yeast/YeastL.net データを読み込んでみましょう
4. Draw → Draw を選択して描画します。最初は、円周上にびっしりリンクが並んだ画像が出てきます。
5. Layout メニューから描画アルゴリズムを変更してみます。
6. 気に入ったレイアウトがあれば、Export → 2D → Bitmap にして出力します。