User:Aritalab/DDBJ/register
From Metabolomics.JP
データの準備
- product名は必須(DNAやATPなどの略号以外の一般的な単語から始まる場合、先頭の文字は小文字で。)
- geneは必須ではない
- 機能不明は hypothetical proteinにしておく。
登録の流れ
- MSSユーザー登録
- D-wayアカウント登録
- BioProject登録 (locus_tag_prefixを取得する)
- BioSample登録
- MSS登録(スキャフォールドの場合)
- WGSエントリー
・コンティグ配列(gapなし) ・アノテーションファイル(commonのみでOK。CDSなどは不要) 登録が完了したら、アクセッションリストを受け取る
- CONエントリー
・AGPファイル(コンティグどうしのつながりを記述) ・アノテーションファイル(CDSの記載必要) ・配列ファイル(optional) 書式は UME で事前チェック
リンク
DDBJ 登録関係 http://www.ddbj.nig.ac.jp/submission_general-j.html
D-way https://trace.ddbj.nig.ac.jp/D-way/
MSS http://www.ddbj.nig.ac.jp/sub/mss_flow-j.html
MSS講習会資料 20140612
http://www.ddbj.nig.ac.jp/ddbjing/dl.html
http://www.ddbj.nig.ac.jp/wp-content/downloads/ddbjing/29ddbjing_MSS.pdf
product名の付け方など有用情報
http://www.ddbj.nig.ac.jp/ddbjnew/mag/column/request-j.html