Help:Extension/ExMolFunctions - Revision history

Editor at 05:26, 1 March 2011

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2011-02-22T05:20:41Z

2011-02-22T04:50:58Z

2011-02-22T04:28:21Z

2011-02-22T04:19:01Z

2011-02-22T02:05:49Z

2011-02-22T02:05:33Z

2011-02-17T06:16:40Z

2011-02-17T06:15:03Z

@@ Line 2: / Line 2: @@
 |author=K, Suwa
 |version=0.1
 }}

@@ Line 14: / Line 14: @@
 この機能はページ更新時に行われるため、importDumpなどの一括登録した場合には機能しません。そのため、一括登録した場合はupdateMol.phpに対象ページ名を列挙したファイルを渡すことで、強制的にページ更新を行うことが出来ます。
 == Requirements ==
@@ Line 53: / Line 74: @@
 Use 100 or larger numbers for xxx. </li>
 </ol>

@@ Line 40: / Line 40: @@
   <li>Insert the follow lines to LocalSettings.php
    <pre>require_once( "$IP/extensions/ExMolFunctions.php" );
-$egMolCalculatorJar = 'path to MolCalculator.jar';
+$egMolCalculatorJar = 'path to MolCalculator.jar from /';
-$egMolImageJar = 'path to armDrawMetabolomics.jar';
+$egMolImageJar = 'path to armDrawMetabolomics.jar from /';
 $egJavaBin = 'path to java binary from /';
 $egTmpPath = 'path to tmp directory from /';

@@ Line 36: / Line 36: @@
 <ol>
   <li>Download the source code and rename it to ExMolFunctions.php and updateMol.php.</li>
-  <li>Place it in the extensions/ directory.</li>
+  <li>Place it in the extensions/ directory. updateMol.phpはwebからアクセスできない場所へ置いて下さい。</li>
   <li>上記jarファイル二つをダウンロードし、適当な場所へ置いて下さい。</li>
   <li>Insert the follow lines to LocalSettings.php

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Line 55:		Line 55:

	== Usage ==		== Usage ==
		+	updateMol.phpの31行目にWikiRootへのパスを設定します。
		+	$IP = "/var/www/htdocs/mediawiki/";
		+
	updateMol.phpに渡すリストは以下のようになっています。これを例えばlist.txtとして保存します。		updateMol.phpに渡すリストは以下のようになっています。これを例えばlist.txtとして保存します。

@@ Line 30: / Line 30: @@
 <table border="1" cellpadding="3" cellspacing="1">
   <tr><td>version</td><td>source</td><td>md5</td><td>OperationCheck version</td></tr>
-  <tr><td>0.1(March 14,2009)</td><td>{{#ifexistfile:/data/src/ExMolFunctions/updateMol.phps}}</td><td><pre style="border: 0px; background-color: white; padding: 0em; line-height: 0em">20408c4b1da04b244ecba817f8a0b369</pre></td><td>1.11.1, 1.16.2</td></tr>
+  <tr><td>0.1(March 14,2009)</td><td>{{#ifexistfile:/data/src/ExMolFunctions/updateMol.phps}}</td><td><pre style="border: 0px; background-color: white; padding: 0em; line-height: 0em">107b89db96dabde0fcc79d4862d43c49</pre></td><td>1.11.1, 1.16.2</td></tr>
 </table>

@@ Line 59: / Line 59: @@
   Mol:Page1
   Mol:Page2
- ...
+  Mol:Page3
-  Mol:PageN
 実行は以下のように行います。

@@ Line 15: / Line 15: @@
 == Requirements ==
-* GUI環境
+* GUI環境(Linuxにおいて、Xサーバが利用できない場合はXvfbが利用できます)
 * Java 1.6
 * [http://metabolomics.jp/data/jar/MolCalculator.jar MolCalculator.jar] 質量計算等を行うプログラム