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		<title>Aritalab:Lecture/NetworkBiology/Stability - Revision history</title>
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		<id>http://metabolomics.jp/mediawiki/index.php?title=Aritalab:Lecture/NetworkBiology/Stability&amp;diff=255274&amp;oldid=prev</id>
		<title>Adm at 20:46, 13 July 2011</title>
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				<updated>2011-07-13T20:46:18Z</updated>
		
		<summary type="html">&lt;p&gt;&lt;/p&gt;
&lt;table class='diff diff-contentalign-left'&gt;
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&lt;tr&gt;&lt;td class='diff-marker'&gt;&amp;#160;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background: #eee; color:black; font-size: smaller;&quot;&gt;&lt;div&gt;です。固有値の一方だけ負なので、これは鞍点です。&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class='diff-marker'&gt;&amp;#160;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background: #eee; color:black; font-size: smaller;&quot;&gt;&lt;div&gt;です。固有値の一方だけ負なので、これは鞍点です。&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class='diff-marker'&gt;−&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background: #ffa; color:black; font-size: smaller;&quot;&gt;&lt;div&gt;====固定点 &amp;lt;math&amp;gt;(b/t,&lt;del class=&quot;diffchange diffchange-inline&quot;&gt;\ &lt;/del&gt;(a - rx^*)/s)&amp;lt;/math&amp;gt; の場合====&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class='diff-marker'&gt;+&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background: #cfc; color:black; font-size: smaller;&quot;&gt;&lt;div&gt;====固定点 &amp;lt;math&amp;gt;(b/t, (a - rx^*)/s)&amp;lt;/math&amp;gt; の場合====&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
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&lt;/table&gt;</summary>
		<author><name>Adm</name></author>	</entry>

	<entry>
		<id>http://metabolomics.jp/mediawiki/index.php?title=Aritalab:Lecture/NetworkBiology/Stability&amp;diff=255273&amp;oldid=prev</id>
		<title>Adm: /* 固定点 (b/t,(a - rx^*)/s) の場合 */</title>
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				<updated>2011-07-13T20:45:32Z</updated>
		
		<summary type="html">&lt;p&gt;‎&lt;span dir=&quot;auto&quot;&gt;&lt;span class=&quot;autocomment&quot;&gt;固定点 (b/t,(a - rx^*)/s) の場合&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;table class='diff diff-contentalign-left'&gt;
				&lt;col class='diff-marker' /&gt;
				&lt;col class='diff-content' /&gt;
				&lt;col class='diff-marker' /&gt;
				&lt;col class='diff-content' /&gt;
			&lt;tr valign='top'&gt;
			&lt;td colspan='2' style=&quot;background-color: white; color:black;&quot;&gt;← Older revision&lt;/td&gt;
			&lt;td colspan='2' style=&quot;background-color: white; color:black;&quot;&gt;Revision as of 20:45, 13 July 2011&lt;/td&gt;
			&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td colspan=&quot;2&quot; class=&quot;diff-lineno&quot;&gt;Line 94:&lt;/td&gt;
&lt;td colspan=&quot;2&quot; class=&quot;diff-lineno&quot;&gt;Line 94:&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class='diff-marker'&gt;&amp;#160;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background: #eee; color:black; font-size: smaller;&quot;&gt;&lt;div&gt;&amp;lt;/math&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class='diff-marker'&gt;&amp;#160;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background: #eee; color:black; font-size: smaller;&quot;&gt;&lt;div&gt;&amp;lt;/math&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class='diff-marker'&gt;&amp;#160;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background: #eee; color:black; font-size: smaller;&quot;&gt;&lt;div&gt;です。固有値の一方だけ負なので、これは鞍点です。&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class='diff-marker'&gt;&amp;#160;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background: #eee; color:black; font-size: smaller;&quot;&gt;&lt;div&gt;です。固有値の一方だけ負なので、これは鞍点です。&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class='diff-marker'&gt;−&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background: #ffa; color:black; font-size: smaller;&quot;&gt;&lt;div&gt;====固定点 &amp;lt;math&amp;gt;(b/t,(a - rx^*)/s)&amp;lt;/math&amp;gt; の場合====&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class='diff-marker'&gt;+&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background: #cfc; color:black; font-size: smaller;&quot;&gt;&lt;div&gt;====固定点 &amp;lt;math&amp;gt;(b/t,&lt;ins class=&quot;diffchange diffchange-inline&quot;&gt;\ &lt;/ins&gt;(a - rx^*)/s)&amp;lt;/math&amp;gt; の場合====&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class='diff-marker'&gt;&amp;#160;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background: #eee; color:black; font-size: smaller;&quot;&gt;&lt;div&gt;ヤコビアンは&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class='diff-marker'&gt;&amp;#160;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background: #eee; color:black; font-size: smaller;&quot;&gt;&lt;div&gt;ヤコビアンは&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;&lt;td class='diff-marker'&gt;&amp;#160;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background: #eee; color:black; font-size: smaller;&quot;&gt;&lt;div&gt;&amp;lt;math&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;td class='diff-marker'&gt;&amp;#160;&lt;/td&gt;&lt;td style=&quot;background: #eee; color:black; font-size: smaller;&quot;&gt;&lt;div&gt;&amp;lt;math&amp;gt;&lt;/div&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;
&lt;/table&gt;</summary>
		<author><name>Adm</name></author>	</entry>

	<entry>
		<id>http://metabolomics.jp/mediawiki/index.php?title=Aritalab:Lecture/NetworkBiology/Stability&amp;diff=255272&amp;oldid=prev</id>
		<title>Adm: Created page with &quot;==系の安定性== 一般的な 2 次元の系 &lt;math&gt;f(x, y),\, g(x,y)&lt;/math&gt; を考え、固定点 (= 時間依存しない解のこと。不動点とも呼ぶ) を &lt;math&gt;(x^*,...&quot;</title>
		<link rel="alternate" type="text/html" href="http://metabolomics.jp/mediawiki/index.php?title=Aritalab:Lecture/NetworkBiology/Stability&amp;diff=255272&amp;oldid=prev"/>
				<updated>2011-07-13T16:40:19Z</updated>
		
		<summary type="html">&lt;p&gt;Created page with &amp;quot;==系の安定性== 一般的な 2 次元の系 &amp;lt;math&amp;gt;f(x, y),\, g(x,y)&amp;lt;/math&amp;gt; を考え、固定点 (= 時間依存しない解のこと。不動点とも呼ぶ) を &amp;lt;math&amp;gt;(x^*,...&amp;quot;&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;&lt;b&gt;New page&lt;/b&gt;&lt;/p&gt;&lt;div&gt;==系の安定性==&lt;br /&gt;
一般的な 2 次元の系 &amp;lt;math&amp;gt;f(x, y),\, g(x,y)&amp;lt;/math&amp;gt; を考え、固定点 (= 時間依存しない解のこと。不動点とも呼ぶ) を &amp;lt;math&amp;gt;(x^*, y^*)&amp;lt;/math&amp;gt; としましょう。&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
:&amp;lt;math&amp;gt;f(x^*, y^*) = 0,\ g(x^*, y^*) = 0&amp;lt;/math&amp;gt;&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
固定点に近い位置を &amp;lt;math&amp;gt; x = x^* + \epsilon_x,\ y = y^* + \epsilon_y&amp;lt;/math&amp;gt; と書いて一次項まで近似すると&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
:&amp;lt;math&amp;gt;&lt;br /&gt;
\begin{align}&lt;br /&gt;
\frac{df}{dt} &amp;amp;= \frac{d\epsilon}{dt} = f(x^* + \epsilon_x, y^* + \epsilon_y)\\&lt;br /&gt;
&amp;amp;= f(x^*, y^*) + \epsilon_x f^{(x)}(x^*, y^*) + \epsilon_y f^{(y)}(x^*, y^*) + \cdots \\&lt;br /&gt;
&amp;amp;\simeq \epsilon_x f^{(x)}(x^*, y^*) + \epsilon_y f^{(y)}(x^*, y^*) &lt;br /&gt;
\end{align}&lt;br /&gt;
&amp;lt;/math&amp;gt;&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
となります。関数 ''g'' についても同様です。これをヤコビ行列の形に書けば&lt;br /&gt;
:&amp;lt;math&amp;gt;&lt;br /&gt;
\frac{d \boldsymbol{\epsilon}}{dt} =\begin{pmatrix}&lt;br /&gt;
 \frac{\partial f}{\partial x} &amp;amp; \frac{\partial f}{\partial y} \\&lt;br /&gt;
 \frac{\partial g}{\partial x} &amp;amp; \frac{\partial g}{\partial y}&lt;br /&gt;
\end{pmatrix} \boldsymbol{\epsilon} = \mathbf{J} \boldsymbol{\epsilon}&lt;br /&gt;
&amp;lt;/math&amp;gt;&lt;br /&gt;
です。ヤコビアンの簡単な場合として対角行列を考えましょう。&lt;br /&gt;
:&amp;lt;math&amp;gt;&lt;br /&gt;
\binom{\frac{d \epsilon_x}{d t}}{\frac{d \epsilon_y}{d t}}&lt;br /&gt;
= \begin{pmatrix}&lt;br /&gt;
  \lambda_1 &amp;amp; 0 \\&lt;br /&gt;
  0 &amp;amp; \lambda_2&lt;br /&gt;
\end{pmatrix} \binom{\epsilon_x}{\epsilon_y}&lt;br /&gt;
&amp;lt;/math&amp;gt;&lt;br /&gt;
この解は以下のようになります。&lt;br /&gt;
:&amp;lt;math&amp;gt;&lt;br /&gt;
\epsilon_x(t) = \epsilon_x(0) e^{\lambda_1 t}, \ &lt;br /&gt;
\epsilon_y(t) = \epsilon_y(0) e^{\lambda_2 t}&lt;br /&gt;
&amp;lt;/math&amp;gt;&lt;br /&gt;
''x'', ''y'' について書き直すと以下になります。&lt;br /&gt;
:&amp;lt;math&amp;gt;&lt;br /&gt;
x(t) = x^* + \epsilon_x(0) e^{\lambda_1 t}, \ &lt;br /&gt;
y(t) = y^* + \epsilon_y(0) e^{\lambda_2 t}&lt;br /&gt;
&amp;lt;/math&amp;gt;&lt;br /&gt;
つまり &amp;lt;math&amp;gt;\lambda_1, \lambda_2&amp;lt;/math&amp;gt; の値（それぞれ固定点における関数 ''f'', ''g'' の微分値) が共に負であれば &amp;lt;math&amp;gt;(x^*, y^*)&amp;lt;/math&amp;gt; は誘引点、共に正であれば反発点、片方だけ負であれば鞍点 (saddle point) となります。&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
ヤコビアンが対角行列でない場合、行がヤコビアンの左固有ベクトルに対応する行列 &amp;lt;math&amp;gt;\mathbf{Q}&amp;lt;/math&amp;gt; を用意し、&amp;lt;math&amp;gt;\xi_x, \xi_y&amp;lt;/math&amp;gt; を定義します。&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
:&amp;lt;math&amp;gt;\boldsymbol{\xi} = \mathbf{Q}\boldsymbol{\epsilon}&amp;lt;/math&amp;gt;&lt;br /&gt;
:&amp;lt;math&amp;gt;\frac{d \boldsymbol{\xi}}{dt} = \mathbf{Q}\frac{d \boldsymbol{\epsilon}}{dt} = \mathbf{QJ} \boldsymbol{\epsilon} = \mathbf{QJQ^{-1}} \boldsymbol{\xi}&lt;br /&gt;
&amp;lt;/math&amp;gt;&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
もし &amp;lt;math&amp;gt;\mathbf{J}&amp;lt;/math&amp;gt; が固有値を持つならば　&amp;lt;math&amp;gt;\mathbf{QJQ^{-1}}&amp;lt;/math&amp;gt; によって対角化することで &amp;lt;math&amp;gt;\xi_x, \xi_y&amp;lt;/math&amp;gt; が互いに独立に時間発展することになります。&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
固有値が複素数になる場合 &amp;lt;math&amp;gt;\lambda_k = \alpha + i \omega\ (k = 1,2)&amp;lt;/math&amp;gt;、一般解は指数的に増減する部分と振動する部分の積になります (''C'': 虚数, ''A, B'': 実数)。&lt;br /&gt;
:&amp;lt;math&amp;gt;\, \xi_k(t) = \mbox{Re}[ C e^{(\alpha+ i\omega)t}] = e^{\alpha t} (A \cos \omega t + B \sin \omega t)&amp;lt;/math&amp;gt;&lt;br /&gt;
パラメータ &amp;amp;alpha; が負の場合は固定点に落ち込むスパイラル（安定点）になり、正の場合は固定点から遠ざかる不安定点です。一点に落ち込むことなく、安定した軌道を描く場合もあります。これをリミットサイクルと呼びます。&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
==ロトカ・ヴォルテラ方程式==&lt;br /&gt;
生態系の解析では、被食者 x と捕食者 y を扱うものが多くあります。以下の仮定を考えます。&lt;br /&gt;
# 被食者は一定割合 ''a'' で増加するが、個体数が多くなりすぎると餌不足で増加率が減少する。&lt;br /&gt;
# 捕食者は一定割合 ''b'' で死滅する。&lt;br /&gt;
以下の方程式を考えます。''a'', ''b'', ''r'', ''s'', ''t'' は全て正のパラメータです。&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
:&amp;lt;math&amp;gt;&lt;br /&gt;
\begin{align}&lt;br /&gt;
\frac{dx}{dt} &amp;amp;= (a - rx - sy)x\\&lt;br /&gt;
\frac{dy}{dt} &amp;amp;= (-b + tx)y&lt;br /&gt;
\end{align}&lt;br /&gt;
&amp;lt;/math&amp;gt;&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
固定点は &amp;lt;math&amp;gt;(x^*,y^*) = (0,0),\ (b/t,(a - rx^*)/s)&amp;lt;/math&amp;gt; です。周辺の挙動をみてみます。&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
:&amp;lt;math&amp;gt;&lt;br /&gt;
\frac{d \boldsymbol{\epsilon}}{dt} =\begin{pmatrix}&lt;br /&gt;
 \frac{\partial f}{\partial x} &amp;amp; \frac{\partial f}{\partial y} \\&lt;br /&gt;
 \frac{\partial g}{\partial x} &amp;amp; \frac{\partial g}{\partial y}&lt;br /&gt;
\end{pmatrix} \boldsymbol{\epsilon} =&lt;br /&gt;
\begin{pmatrix}&lt;br /&gt;
 a - 2rx^* - sy^* &amp;amp; -sx^* \\&lt;br /&gt;
 ty^* &amp;amp; -b + tx^*&lt;br /&gt;
\end{pmatrix} \boldsymbol{\epsilon} &lt;br /&gt;
&amp;lt;/math&amp;gt;&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
行列の固有方程式&lt;br /&gt;
:&amp;lt;math&amp;gt;\,&lt;br /&gt;
\lambda^2 - (J_{11} + J_{22})\lambda + J_{11}J_{22}-J_{12}J_{21} = 0&lt;br /&gt;
&amp;lt;/math&amp;gt;&lt;br /&gt;
を考え、固有値がともに負になるかを検討します。&lt;br /&gt;
&lt;br /&gt;
====固定点(0,0)の場合 ====&lt;br /&gt;
ヤコビアンは&lt;br /&gt;
&amp;lt;math&amp;gt;&lt;br /&gt;
\begin{pmatrix}&lt;br /&gt;
a &amp;amp; 0 \\&lt;br /&gt;
0 &amp;amp; -b &lt;br /&gt;
\end{pmatrix}&lt;br /&gt;
&amp;lt;/math&amp;gt;&lt;br /&gt;
です。固有値の一方だけ負なので、これは鞍点です。&lt;br /&gt;
====固定点 &amp;lt;math&amp;gt;(b/t,(a - rx^*)/s)&amp;lt;/math&amp;gt; の場合====&lt;br /&gt;
ヤコビアンは&lt;br /&gt;
&amp;lt;math&amp;gt;&lt;br /&gt;
\begin{pmatrix}&lt;br /&gt;
0 &amp;amp; -s x^*\\&lt;br /&gt;
t y^* &amp;amp; 0 &lt;br /&gt;
\end{pmatrix}&lt;br /&gt;
&amp;lt;/math&amp;gt;&lt;br /&gt;
です。この場合の固有値は複素数となり、実数部分を持ちません。そのため、固定点に落ち込んでいくことのない（吸引的でない）安定点になります。&lt;br /&gt;
この方程式で ''r'' = 0 とおいた場合が、大変有名なロトカ・ヴォルテラ方程式です。&lt;/div&gt;</summary>
		<author><name>Adm</name></author>	</entry>

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