http://metabolomics.jp/mediawiki/index.php?action=history&feed=atom&title=Aritalab%3ALecture%2FNetworkBiology%2FOverview 2026-05-26T08:45:05Z Revision history for this page on the wiki MediaWiki 1.19.1 http://metabolomics.jp/mediawiki/index.php?title=Aritalab:Lecture/NetworkBiology/Overview&diff=255148&oldid=prev 2010-07-22T01:14:07Z

<p>New page: =概要= ==ネットワーク生物学の歴史== ; 1990s 後半 : ページランクアルゴリズム (Brin &amp; Page)、HITSアルゴリズム (Kleinberg)によるハブの解析 : スケ...</p> <p><b>New page</b></p><div>=概要=<br /> <br /> ==ネットワーク生物学の歴史==<br /> ; 1990s 後半<br /> : ページランクアルゴリズム (Brin &amp; Page)、HITSアルゴリズム (Kleinberg)によるハブの解析<br /> : スケールフリーネットワークの生成モデル　(Barabasi &amp; Albert)<br /> : スモールワールドネットワークの生成モデル　(Watts &amp; Strogatz)<br /> ; 2000s　前半<br /> : 代謝、タンパク質ネットワークのスケールフリー性 (Barabasi et al.)<br /> : ネットワークモチーフ、モジュラリティ (Alon)<br /> : システム生物学 (Kitano)<br /> ; 2000s 後半<br /> : 様々なネットワーク指標<br /> : 遺伝子ネットワーク、感染ネットワーク等のスケールフリー性<br /> <br /> ==ネットワーク解析の手法==<br /> ===生成モデル===<br /> * Erdos-Renyi モデル<br /> * Barabasi-Albert モデル<br /> * Watts-Strogatz　モデル<br /> <br /> ===ネットワークの特徴量===<br /> * Centrality ... degree, closeness, betweenness<br /> * Prestage ... degree, proximity, rank<br /> <br /> ===相転移、臨界現象===<br /> ;パーコレーション<br /> : クラスターと浸透確率　（一次元、ベーテ格子）<br /> : ネットワーク上のパーコレーション<br /> <br /> ===ダイナミクス===<br /> ; マルコフ連鎖<br /> : マルコフ連鎖の定義<br /> : 生成消滅過程<br /> : グラフ上のランダムウォーク</div>

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